Un ensemble de gènes situés sur le chromosome 6, gènes très proches les uns des autres, codent pour les molécules HLA. Les HLA peuvent être classés en MHC de classe I ,II et III. Pour désigner un allèle spécifique au niveau d'un locus HLA donné, "HLA" s'utilise avec l’addition d’une lettre et des chiffres (ex. HLA-B41…)
Les gènes HLA les plus étudiés sont:
pour le complexe I :
HLA-A, HLA-B, HLA-C, (présentation HLA-I classique) ; HLA-E, F, G (rôles dans la tolérance et la réponse NK) ; ‘HLA-I like’ MIC A et B (rôle dans la réponse NK)
pour le complexe II :
HLA-DP, HLA-DQ, HLA-DR (molécules de présentation HLA) ; HLA-DM, DO ; TAP, LMP 1 à 7 (protéasome)
pour le complexe III
Gènes n’ayant aucun rôle direct dans la réponse immunitaire (hydrolase,
hormones stéroïdiennes) ; Gènes impliqués dans la réponse immune : « protéines du complément (C4A, C4B)» TNFα, Ltβ.